En la década del 90 Santa Cruz recibió una gran cantidad de inversiones por diferentes rubros, potenciando su economía y consolidándola como la primera del país. Entre esos montos que recibió estuvieron los 100 millones de dólares anuales de inversión pública.
También a esta parte del país le ingresaron, entre 1996 y 2000, un total de 400 millones de dólares de la inversión extranjera, siendo un 46,5% del total que captó el país.
A ello se sumó, que, a partir de 1997, el país multiplicó las inversiones en explotación y exploración de hidrocarburos en relación al periodo entre 1990 y 1997. Además, al final de la década de 1990, se concretó la exportación de gas a Brasil, así como la construcción del gasoducto de exportación a dicho país.
Con ello la economía empezó a diversificarse mediante las exportaciones de gas natural, soya y zinc. Asimismo, se descentralizó la gestión del estado por medio de la Ley de Participación Popular que otorgó autonomía y recursos a los municipios.
La expansión de la frontera agrícola en los últimos 20 años del siglo XX provocó que la extensión cultivada en 1990 sobrepasara el millón de hectáreas. Asimismo, durante este período hubo un aumento considerable de la industria maderera y de la ganadería.